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会有一定的出错几率，不过不高，因为任何的医疗技术都存在一定的局限性，而且在医疗领域也没有百分百一说。三代试管婴儿pgd技术筛查基因类疾病是通过从胚胎中取1到数个细胞或者促排卵细胞的第一极体在种植前进行染色体基因分析，该技术可以对22对常染色体以及1对性染色体进行基因分析，所以准确率还是很高的。
三代试管的优势就在于可通过PGD技术进行疾病筛查，从而阻断一些遗传性疾病，对于很多不孕家庭来说这样可以在很大程度上实现优生的目的，不过这种技术也存在一定的误差率，而影响其准确率的因素主要包括以下这几个。
1、检测技术限制：PGD可能无法检测出所有的遗传异常。这可能是由于基因突变的复杂性、胚胎样本的质量或检测技术的限制所致;
2、操作误差：PGD技术涉及多个复杂的步骤，包括胚胎活检、基因扩增和测序等。在操作过程中，任何环节出现误差都可能影响最终的诊断结果。例如，活检过程中可能损伤胚胎，导致误诊或漏诊;
3、胚胎质量：PGD技术依赖于胚胎样本进行基因检测。然而，并非所有胚胎都能提供足够高质量的样本。低质量的胚胎样本可能导致基因检测结果不准确;
4、样本误差：在提取胚胎细胞进行PGD时，如果样本处理不当，可能会导致细胞损伤或污染，从而影响检测结果的准确性。
大体上来说三代试管的PGD技术还是可以确保移植胚胎的健康状况，但是该技术也无法百分百能筛查所有的基因类疾病，再者移植后胚胎在妈妈子宫腔内这期间还存在很多不确定因素会对其发育产生影响，所以临床上也会有做三代试管依然生下有问题的孩子。
