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显示在不同参数中精子形态学参数对生育力的预测最佳，其计算出的临界值分别为10％和9%，但等对数据敏感性和特异性分析得出的临界值为12%，而第四项研究计算出的具有预测力的临界值为4%。虽然该值的敏感性和特异性相对较高，但是阳性预测力并非如此，它会将正常生育力的男性划归为生育力低下人群，进而导致一定程度的不安以及不必要和昂贵的不育症治疗。这四篇文章中的第三篇给出的临界值很低,利用正常生育力人群的第十百分位数来计算他们的临界值，等在利用阳性预测值作为指示来筛查人群时，假定他们研究的人群中生育力低下有50％的流行率。较低的临界值介于3%~5％之间，与较高的临界值相比，这些较低的临界值具有非常高的阳性预测值，同时阴性预测值并不很低。根据人群中预计生育力低下人群发生率得出的区分一般人群正常生育力和低生育力的低限临界值。
卵巢过度刺激综合征（OHSS）是促排卵的另一个严重的并发症。其可能是轻度的也可能是严重威胁生命而需要住院治疗的。不论是否经过恰当治疗，血栓形成都是严重OHSS的最具危害的并发症，可能最终导致死亡。尽管重度OHSS的发生率很低，但要记住OHSS并非是为抢救生命而进行的治疗中发生的医源性并发症，这一点非常重要。ART治疗而出生的婴儿中，出生缺陷的发生风险是一个具有争议的问题。大部分的研究ICSI与IVF出生婴儿与自然出生婴儿出生缺陷比较的出版物都有严重的方法学上的局限；大部分的研究者都忽略这一点而得出风险没有增加的结论。Hansen等对2003年以前出版的关于比较IVF和（或）ICSI出生的婴儿与自然妊娠出生婴儿出生缺陷发生的所有资料进行了系统回顾。依照这一回顾，综合相关研究结果表明，ART后出生的婴儿与自然妊娠出生的婴儿相比较，发生出生缺陷的风险是增加的。这一点是应该让寻求ART治疗的夫妇知道的。控制性超促排卵要将卵巢暴露于超生理水平的促性腺激素之下而使大量的卵泡发育以帮助受孕。激素治疗在癌症发生上的远期效应尚不明了。一些学者特别提出了对在卵巢刺激过程中和之后卵巢癌发生风险的担心。将避孕药的使用和妊娠次数这样的混淆因子去除调整后的研究表明，长期不避孕而仍无子女的不孕妇女卵巢癌风险增加。这些妇女的风险是来自她们的不孕本身还是由于促排卵药物的作用已经成为许多研究的主题。目前为止，卵巢癌的风险与不孕症药物治疗具有相关性是肯定的，但尚未最后确定。已观察到在不孕治疗药物和卵巢交界性肿瘤之间有更紧密的联系。
近年来，高质量的临床观察和基础生物学研究显示某些疾病可能导致男性不育，而且已经开发出了很多有效的治疗方法。主要由男性因素所致不孕不育的比例逐渐增加尤其是生物学家和妇产科医生采用辅助生殖技术检测到了越来越多的精液质量异常的男性。但是，随着时间的推移，各种致病因素的流行病学已经发生了改变，某些特定疾病逐渐变得少见（生殖道感染所致的梗阻性无精子症），而更常检测到另外的一些疾病（如精索静脉曲张）。受精卵形成后，就会经由输卵管向子宫移动，这个过程需要3～4天的时间。在这几天内，细胞会按照几何级数不停地分裂，总共分裂43次，才会形成一个完整的受精卵细胞，这时的受精卵就叫作胚囊或胚胎。第2周在激素的作用下，子宫内膜已经做好了欢迎胚胎到来安家的准备。胚胎进入子宫腔后，在子宫内漂浮7～10天后才有力量附着在子宫内膜上，也就是“着床”。胚胎着床的位置通常在子宫上部的l/3处，或是接近子宫顶端。着床后，子宫就为受精卵继续生长发育提供了温床。子宫为了适应胚胎的存在，开始发育胎盘。通过胎盘，胎儿可以吸收母体血液中的营养。同时，胎儿产生的废物也可以通过胎盘排出去。
胰岛素抗性、高胰岛素血症和雄激素过多症性患者会产生胰岛素抗性问题。胰岛素抗性被定义为：当给予患者定量的胰岛素时，其葡萄糖反应降低。它不同于对内源性胰岛素产生抗性的情况，后者是指当血清胰岛素水平高，而血糖处于正常或偏高水平。胰岛素抗性会导致脂蛋白紊乱以及体型改变，并容易发生早期心血管疾病。已提出多种技术用以评估患者的胰岛素敏感性。其中金标准是葡萄糖钳夹技术，但此技术不能反映患者的生理状况。被广为接受的替代技术有静脉注射葡萄糖耐量测试，空腹胰岛素和葡萄糖测量以及口服。可以测定胰鸟素的分泌及其作用情况，但不能直接测量胰岛素敏感性。实际上胰岛素抗性并不属于鹿特丹标准之一，诊断和治疗中也不包括胰岛素抗。
