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亚临床流产，也称生化妊娠，即hCG水平升高足以提示出现妊娠，但在超声发现妊娠囊之前即出现下降．而染色体正常的胚胎发生临床流产可能是因为子宫内膜未能出现足够的生长。生化妊娠时由于没有可以进行染色体分析的妊娠生成物（POC )，所以其妊娠失败的原因难以确定。但是，有52％的自然流产患者的POC染色体分型是正常，所以有人假设子宫内膜生长不足可能至少与部分早期妊娠的胚胎丢失有关。有一项研究对IUI中连续OI周期时子宫内膜厚度和分型与妊娠结局的关系进行了分析，发现hCC给药日时子宫内膜厚度在6~8mm时发生生化妊娠的比例为21.9%，而子宫内膜厚度为9mm或以上时则无生化妊娠发。子宫内膜厚度为6~8mm时发生妊娠，超声发现妊娠囊后出现临床流产的比例为15.6%，而子宫内膜厚度为9mm或以上时发生妊娠，其临床流产率为12.2%。统计学分析认为生化妊娠与子宫内膜厚度和分型显著相关，而与母亲年龄或既往的自然流产次数无关。相反，临床流产则与母亲年龄以及既往的自然流产次数显著相关，而与子宫内膜厚度或分型无关。一项较早的关于IVF和GIFT结局的研究认为，三线型子宫内膜与成熟的卵细胞数量和优质胚胎数显著相关，与血清中雌激素水平也有相关。
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