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染色质包装密度苯胺蓝（aniline blue , AB）染色显示DNA包装异常的精子核染色质蛋白更易于同酸性染料结合。精子酸性AB着色（蓝色）增加表明染色质包装松散。同时也提示因过多的组氨酸残留造成和蛋白更易于被碱性基团结合。这种大颗粒的染料无法同正常精子（核蛋白主要为鱼精蛋白成分）中包装致密的染色质结合。酸性AB对精子核蛋白的评价结果与AO实验具有良好的一致性（90)，而且其结果所反映的异常染色质精子数量与男性不育之间具有明确的相关性。但是AB﹣染色精子的百分率与其他精液参数之间的关系依然存在争议。其中一个重要的发现就是，苯胺蓝染色显示的染色质浓集水平是IVF结局一个较好的预测指标，但是它不能反映ICSI后的受精潜能、卵裂情况和妊娠率。染色质蛋白与AO实验相似，染色质结构分析（SCSATM )主要对AO染色的绿色荧光（自然的DNA）向红色荧光（变性的或松散的DNA或RNA发生异染性转变进行定量，在原位检测精子核DNA对酸诱导构象转变的易感程度。
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TORCH筛查与诊断的乱象
混乱一：假阳性率高
如前所述，不少医院所采用的是简单的定性试验，导致假阳性率偏高，部分医生过度解读，在不做确诊试验的前提下就建议终止妊娠。
混乱二：做的时间不对
出生缺陷的管理原则是三级预防，比较好是一级预防，也就是在孕前进行TORCH筛查，确定女性的免疫状态，发现高危人群。其次是二级预防，也就是在怀孕后进行TORCH筛查和必要的产前诊断。然后是三级预防，就是对新生儿进行TORCH检查，早发现、早干预。现在大家普遍是在怀孕后才做TORCH筛查，而且是在进入孕中期以后才做，让医生无法准确判断感染的时间段，这就让结果的解读很困难。另外，TORCH感染导致的异常表型也很难在宫内得到诊断，例如耳聋和对智力的影响，这些异常用超声检查是无法发现的，这也是临床医生的无奈之一。
混乱三：解读离谱
多数临床医生对TORCH感染的后果、筛查和诊断缺乏系统科学的了解。在教科书和文献中，对TORCH感染的后果均存在不同程度的夸大，把病原体大流行时期的资料和结果应用到非大流行时期。例如风疹病毒发生变异，毒力明显增强时会导致风疹病毒感染的大流行，这时候就会导致比较高的胎儿出生缺陷发生率。而在非大流行时期感染风疹病毒，就不一定导致这么严重的伤伤害，把病毒大流行时期的资料应用到非大流行时期，显然不合适。
