南京做三代试管婴儿成功率高的有江苏省人民医院、南京鼓楼医院、东部战区总医院和南京市妇幼保健院等，这些医院做三代试管婴儿的技术都好，成功率也是比较高的。而且这家医院可做三代试管婴儿，加上这几家医院开展辅试管技术全面，而且成功率也都在国内水平。
目前南京市内医疗机构众多，具有卫计委批准并且已经获得辅试管技术资质的医院一共有七家，大部分可同时开展夫试管婴儿技术、一代、二代三代试管婴儿技术，其中江苏省人民医院、南京鼓楼医院、南京妇幼保健院、东部战区总医院内还增设有独立的试管医学中心，是南京市为数不多的可同时开展三代试管婴儿技术的辅试管机构。以下是南京做三代试管婴儿成功率高的医院：医院名称成功率技术
江苏省人民医院41%-70%一、二、三代
南京鼓楼医院42%-70%一、二、三代
南京市妇幼保健院50%-65%一、二、三代
东部战区总医院50%-70%一、二、三代
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